Korzystanie z funduszy strukturalnych a zwolnienie z PIT

Artykuł 21 ust. 1 pkt 46 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych przewiduje zwolnienie między innymi dla podatników bezpośrednio realizujących program finansowany ze środków bezzwrotnej pomocy wypłacanych z funduszy strukturalnych Unii Europejskiej. Zwolnienie dotyczy jedynie tych podatników, którzy są bezpośrednimi beneficjentami pomocy bezzwrotnej. Pracownicy, którzy jedynie wykonują zadania określone w programie finansowanym z funduszy strukturalnych, nie są bezpośrednim beneficjentem środków z bezzwrotnej pomocy, nie dotyczy ich więc powyższe zwolnienie od podatku — orzekł Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie.

O co toczył się spór?

Fundacja realizuje program finansowany ze środków Europejskiego Funduszu Społecznego. Środki te rozdzielane są między innymi przez Polską Agencję Rozwoju Przedsiębiorczości na podstawie umowy między Agencją a beneficjentem środków. Na podstawie umowy Agencja zobowiązana jest do refundacji wydatków poniesionych przez fundację przy wykonywaniu zadań wynikających z finansowanego programu. Zadania te fundacja realizuje poprzez swoich pracowników. Następnie otrzymują oni wynagrodzenie od fundacji, które potem są jej refundowane przez Agencję.

Fundacja wystąpiła z wnioskiem o wydanie interpretacji podatkowej. Chciała wiedzieć, czy wynagrodzenia pracowników są zwolnione od podatku na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 46 Ustawy z dnia 26 lipca 1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (t.j. Dz. U. z 2000 r. Nr 14, poz. 176, z późn. zm., dalej: u.p.d.o.f.). Jej zdaniem wynagrodzenia pracowników realizujących program finansowany z funduszy strukturalnych refundowane ze środków unijnych powinny być zwolnione od podatku dochodowego od osób fizycznych.

Organy podatkowe uznały stanowisko fundacji za nieprawidł...